O Museu Arqueológico Nacional foi fundado em 1867 pela Rainha Isabel II, seguindo a tendência europeia de criar grandes museus nacionais para expor os testemunhos do passado de cada nação.
A sua fundação satisfez a procura de uma grande instituição onde as coleções de artefatos históricos espalhados pudessem ser reunidas sob um mesmo teto, com o objetivo de documentar toda a história da Espanha, desde os seus primórdios até dias atuais, e oferecer uma visão geral das civilizações antigas de todo o mundo.
A ideia se consolidou graças aos avanços da arqueologia da época e a uma crescente conscientização sobre o patrimônio cultural de valor incalculável que, como resultado de invasões, guerras e confiscos governamentais, corria o risco de desaparecer e exigir proteção.
A missão do novo museu era coletar, preservar e estudar esses bens e disponibilizá-los ao público em geral para sua edificação e instrução.
O museu é o guardião de objetos de enorme valor artístico, histórico e cultural.
Sua missão é protegê-los, preservá-los, estudá-los e exibi-los.